免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一種經典的用于研究蛋白質相互作用的方法，它基于抗體和抗原之間的專一性作用。該技術主要用于確定兩種蛋白質在完整細胞內的生理性相互作用。基本原理：當細胞在非變性條件下被裂解時，細胞內蛋白質-蛋白質間的相互作用被保留下來。通過利用預先固化在agarose beads上的蛋白質A的抗體來免疫沉淀A蛋白，與A蛋白在體內結合的蛋白質B也能一起沉淀下來。隨后，通過蛋白變性分離，可以對B蛋白進行檢測，從而證明兩者之間的相互作用。IP-Mass（免疫沉淀-質譜）技術應用場景。湖北互作機制CoIP WB
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用：低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質之間的相互作用可能檢測不到，這可能導致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用：免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質的結合可能不是直接結合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制：免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術，如親和色譜，這可能影響到對低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高：如果將蛋白復合物直接進行質譜分析，需要得到較高純度和濃度的蛋白復合物樣品，這并非易事，并且成本較高。對抗體要求高：用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適，與Western blotting或者 ELISA相比容易出現假陽性反應。互作機制CoIP-Western Blot免疫共沉淀實驗涵蓋樣品處理、抗體處理、共沉淀、洗滌及蛋白鑒定，確保精確檢測蛋白相互作用。
Co-IP技術作為研究蛋白質相互作用的重要手段，其結果在多數情況下是可靠的。然而，該技術也存在一些潛在的限制和影響因素，需要研究人員予以注意。在實際應用中，由于細胞內蛋白質種類繁多且相互作用復雜，可能會出現非特異性結合或背景噪聲，這要求研究者選擇特異性強的抗體，并通過洗滌步驟去除雜質。此外，樣品的純度、抗體的質量和實驗條件等也會對結果產生影響，因此，對抗體的選擇和驗證、樣品的準備以及實驗條件的控制都至關重要。為了進一步提高結果的準確性，研究人員通常會結合多種方法進行相互驗證，如使用不同抗體或實驗條件重復實驗，或結合質譜技術來驗證Co-IP的結果。這些措施共同增強了Co-IP技術結果的可靠性。
Co-IP（免疫共沉淀）實驗的內源檢測是驗證蛋白質相互作用的關鍵步驟。內源檢測的目的是確認在細胞內自然狀態下，目標蛋白與預測相互作用的蛋白是否真實存在相互作用。內源檢測的成功與否直接關系到Co-IP實驗結果的可靠性。如果內源檢測結果陽性，說明目標蛋白與預測相互作用的蛋白在細胞內真實存在相互作用，這為后續的蛋白質功能研究和藥物開發提供了重要的線索和依據。需要注意的是，內源檢測可能受到多種因素的影響，如抗體特異性、細胞裂解條件、洗滌條件等。因此，在進行Co-IP實驗時，需要嚴格控制實驗條件，選擇特異性強的抗體，并進行充分的洗滌步驟，以確保內源檢測結果的準確性和可靠性。Co-IP探究蛋白互作，ChIP研究轉錄調控，各擅勝場，選擇需依研究目標！
IP-WB（免疫沉淀-Western Blot）實驗要點主要包括以下幾個步驟：樣品制備：確保樣品新鮮且未經過多次凍融，以避免蛋白降解。裂解細胞或組織，獲得含有目標蛋白及其相互作用伙伴的裂解液。免疫沉淀：選擇特異性強的抗體，與目標蛋白結合形成復合物。將復合物與固相載體（如磁珠）結合，通過洗滌去除非特異性結合的雜質。電泳分離：將免疫沉淀得到的蛋白質復合物進行SDS-PAGE凝膠電泳，按照分子量大小分離蛋白質。Western Blot檢測：將電泳后的蛋白質轉移到固相膜上，利用特異性抗體檢測目標蛋白或其相互作用伙伴的存在。通過顯色反應可視化目標蛋白，確保特異性結合。結果分析：觀察Western Blot結果，分析目標蛋白與其相互作用伙伴的相互作用情況，為后續研究提供依據。CoIP實驗技術重復和生物重復設計建議。四川免疫沉淀檢測CoIP Mass檢測
IP-WB技術結合免疫沉淀與Western Blot，高特異、高靈敏驗證蛋白互作，支持功能研究與藥物開發！湖北互作機制CoIP WB
Co-IP實驗的外源檢測是一種通過引入外源表達的蛋白來驗證蛋白質間相互作用的方法。與外源檢測相對的是內源檢測，即檢測細胞內自然狀態下蛋白質間的相互作用。在外源檢測中，研究者通常會在細胞中轉染含有特定基因的質粒，使該基因在細胞內過量表達，從而產生大量的外源蛋白。然后，利用特異性抗體對這些外源蛋白進行免疫共沉淀（Co-IP），并通過Western Blot等技術檢測與其相互作用的蛋白是否也被沉淀下來。這種方法有助于驗證蛋白質間的相互作用，并確定相互作用的具體條件或影響因素。同時，由于外源蛋白的表達量較高，因此外源檢測通常比內源檢測更為敏感，更容易檢測到較弱的相互作用。然而，需要注意的是，外源檢測的結果可能受到多種因素的影響，如外源蛋白的表達水平、轉染效率、細胞狀態等。因此，在進行外源檢測時，需要嚴格控制實驗條件，確保實驗結果的準確性和可靠性。同時，為了更好地了解蛋白質間的相互作用，通常需要結合內源檢測和外源檢測的結果進行綜合分析。湖北互作機制CoIP WB