一級結構是蛋白質分子中氨基酸以肽鍵連接的順序，每一種蛋白質分子，都有其特定的氨基酸組成和排列方式，由此就決定了不同的空間結構和功能。蛋白質分子中一級結構關鍵部位氨基酸的改變，會直接影響其功能，這個關鍵部位就是蛋白質分子的活性中心。已發現并確認了不下30種類型的膠原蛋白。一般的蛋白質是雙螺旋結構，而作為細胞外基質（ECM）的一種結構蛋白，膠原蛋白由三條多肽鏈構成三股螺旋結構，或稱膠原域，即3條多肽鏈的每條都左旋形成左手螺旋結構，再以氫鍵相互咬合形成牢固的右手超螺旋結構。膠原特有的左旋a鏈相互纏繞構成膠原的右手復合螺旋結構，這一區段稱為螺旋區段，螺旋區段比較大特征是氨基酸呈現（Gly-X-Y）n周期性排列，其中X、Y位置為脯氨酸（PrO）和羥脯氨酸（Hyp），是膠原蛋白的特有氨基酸，約占25%，是各種蛋白質中含量比較高的；膠原蛋白中存在的羥基賴氨酸（Hyl）在其它蛋白質中不存在，它不是以現成的形式參與膠原的生物合成，而是從已經合成的膠原的肽鏈中的脯氨酸（Pro）經羥化酶作用轉化來的。而一般陸生哺乳動物蛋白質中羥脯氨酸和焦谷氨酸的含量極微少。與陸生動物相比，水生動物中的膠原蛋白，其脯氨酸和羥脯氨酸的總量少。 采用酶法提取膠原蛋白及其多肽的研究主要是從動物皮及其加工副產物中。廣東大豆膠原蛋白功效和作用
由于無脊椎動物與脊椎動物在進化上相距遙遠，它們的膠原性質存在明顯的差異。水產無脊椎動物的膠原主要可分為兩類，類Ⅰ型及類Ⅴ型膠原，均相當于脊椎動物的Ⅰ型膠原。其中類Ⅰ型膠原比較富含有丙氨酸和糖結合型的羥賴氨酸，比較廣的存在于軟體動物的各種部位中，包括：烏賊類的皮和頭蓋軟骨、章魚的皮鮑的肌肉和外套膜等。類Ⅴ型膠原是丙氨酸含量比較少、富含糖結合型羥賴氨酸，已從磯海葵的中膠層、節足動物蝦類和蟹類的肌肉及皮下膜以及原索動物羅氏石勃卒的肌膜體中分離出來。與脊椎動物相比，水產無脊椎動物的膠原明顯難溶，富含于羥賴氨酸，尤其是糖結合型含量多，而且纖維的直徑小于50nm。 重慶大豆膠原蛋白廠家膠原蛋白分子經水解后主要形成相對分子量較小的膠原多肽。
由于氨基酸組成和交聯度等方面的差異，使得水產動物尤其是其加工廢棄物——皮、骨、鱗中所含有的豐富的膠原蛋白具有很多牲畜膠原蛋白所沒有的優點，另外來源于海洋動物的膠原蛋白在一些方面明顯優于陸生動物的膠原蛋白，比如具有低抗原性、低過敏性等特性。因此水產膠原蛋白可能逐步替代陸生動物膠原蛋白。膠原蛋白種類較多，常見類型為Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅴ型和Ⅺ型。膠原蛋白因具有良好的生物相容性、可生物降解性以及生物活性，因此在食品、醫藥、組織工程、化妝品等領域獲得比較廣的應用。
所以，若想提取結構完整、使用安全的膠原蛋白，很少采用此方法。有關單獨采用堿法提取膠原蛋白的報道不多，一般是堿法提取和酸法提法結合使用。比如在4℃條件下，魚骨用0.1moL/L的NaOH浸泡6h，再用2.5%NaCl浸泡6h去除雜蛋白，用10%的異丙醇溶液去除脂肪，0.1moL/L的檸檬酸浸泡3d，現在得到無色無味的膠原蛋白，提取率為11.87%。注意，無論酸法或堿法，均可有效地提取膠原蛋白，有人分別采用醋酸-鹽酸的混合酸液（pH3.0）和NaOH溶液（pH12.0）提取骨膠原蛋白，提取率基本相當。但是，這兩種方法提取膠原蛋白不僅容易影響膠原蛋白的生物活性，而且提取后產生的酸性或堿性廢液必須進行適當處理，以避免對環境造成污染。采用不同濃度的氯化鈉對提取的膠原蛋白進行鹽析處理，可以沉淀出不同類型的膠原蛋白。
相對于較大分子膠原蛋白而言，膠原三肽更能有效的服務于人類的健康與美麗。膠原三肽主要具有以下功能：保濕：膠原三肽中含親水性的天然保濕因子，而且穩定的三螺旋結構能強勁鎖住水分，讓皮膚時刻保持濕潤、水嫩的狀態！膠原蛋白與膠原肽均具有保濕的作用，由于CTP即含有分子量小的部分，又含有分子量大的部分，因此它不僅具有同樣的護膚作用，且更為穩定和明顯。應用阻抗儀測定電導度值來表征角質層的水分含量。結果表明，CTP的應用不僅保持住水分，而且是其水分含量增加，起到了保濕作用。公司生產加工魚膠原蛋白肽、深海魚低聚肽、牛骨髓肽、大豆肽、牡蠣肽、蠶蛹肽、豌豆肽等等膠原蛋白肽制品。重慶海參膠原蛋白肽口服液
補充膠原三肽，能更有效的將皮膚細胞撐起，結合保濕和抑制皺紋的作用。廣東大豆膠原蛋白功效和作用
采用酶法提取膠原蛋白時，必須嚴格控制提取條件：首先，酶作用時間必須適當。如果時間過短，膠原蛋白就不能充分釋放到提取液中，影響提取率；如果酶作用時間過長，膠原蛋白會水解過度，產生過多的苦味小分子低聚肽，不僅會增加分離純化的難度，也會影響膠原蛋白的功能特性和生物活性。其次，酶解溫度要適宜。溫度過低，酶的作用效果不明顯；溫度過高會引起酶的失活和膠原蛋白的變性。據報道，當介質pH略低于中性時，膠原蛋白的變性溫度為40～41℃，當介質pH為酸性時，膠原蛋白的變性溫度為38～39℃，而且魚皮膠原蛋白的變性溫度要比豬皮膠原蛋白的變性溫度低7～12℃。所以，如果要使提取的膠原蛋白具有良好的生物活性，在提取過程中應使提取溫度低于變性溫度。第三，需選用適當的酶。一般從陸生哺乳動物組織中提取膠原蛋白時，采用胃蛋白酶在其較適作用溫度下進行提取是合理的，但對于魚類等水生動物，由于其膠原蛋白的變性溫度比陸生哺乳動物低，因此許多蛋白酶便不適用，如果在這些酶的較適作用溫度下提取可能會破壞膠原蛋白的某些功能特性和生物活性。采用酶法提取膠原蛋白及其多肽的研究主要是從動物皮及其加工副產物中。 廣東大豆膠原蛋白功效和作用
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