一級結構是組成膠原蛋白多肽鏈的氨基酸序列；膠原蛋白分子是由3條左手螺旋（二級結構）的多肽鏈組成，它們相互纏繞形成一個在中心分子軸周圍的右手螺旋（三級結構）；完整的膠原蛋白分子的長度約280nm，直徑約；在Ⅰ型膠原原纖維的二維結構（小角X線衍射圖譜和透射電子顯微照片）中，膠原分子通過一個或多個4D距離與另一個膠原分子交錯，D表示在小角X線衍射圖譜中所見的基本重復距離，或電子顯微照片中所見的重復距離。因為膠原分子的長度約是，膠原分子的交錯引起約有。由于膠原是細胞外間質成分，在體內以不溶性大分子結構存在，并與蛋白多糖、糖蛋白等結合在一起，因此膠原的制備包括材料的選擇、預處理、酸堿酶鹽水法提取、不同類型膠原的分離和純化。 皮膚的光澤取決于含水量，膠原三肽良好的保水能力使皮膚水潤亮澤，散發健康的光彩。廣東魚膠原蛋白廠家
免疫學分析和研究結果表明，使用膠原加完全弗氏佐劑，能對膠原產生多克隆和單克隆抗體。由T細胞啟動的對膠原蛋白免疫反應的證據是，位于重要組織相容性（H-2）部位上ⅠA或ⅠB亞區的免疫反應基因已被鑒定。膠原蛋白免疫原性的臨床評價通常是皮膚過敏性測試（細胞免疫指數，遲發性Ⅳ型反應）和由反應型抗體的存在（體液免疫指數）來確定的。實踐證明，在患者身上進行這兩種評價是合理的。在治好前，用過敏劑量的植入性膠原對患者進行皮試，大約3%有潛在的反應，反復多次處理的患者，大約1%～2%會產生遲發性過敏性的臨床病狀。典型的癥狀包括局部水腫和紅斑反應，有的還伴有硬化和瘙癢，持續時間4～6個月，個別甚至可達1年以上。山東口服膠原蛋白粉采用酶法提取膠原蛋白及其多肽的研究主要是從動物皮及其加工副產物中。
有人以豬骨為原料，用蛋白酶的酶解反應代替傳統制膠工藝，對骨膠原的酶解反應與酶法制膠工藝進行了試驗研究。結果表明：以胃蛋白酶對骨膠原的提取率比較高（），其次是胰蛋白酶（），接下來是中性蛋白酶（），現在是堿性蛋白酶（）。并且通過單因素和正交試驗對胃蛋白酶酶解反應中各主要影響因素進行了優化。試驗結果表明，胃蛋白酶提取的比較好條件是，胃蛋白酶的濃度是1%，在，然后在濃度為10%（w/v）的NaCL溶液中鹽析24h，現在骨膠原的回收率為，骨膠原的提取率為。還有人用胃蛋白酶提取豬皮膠原蛋白，分別在水解0、2、6、10、14、18、22、26h時對四種不同胃蛋白酶用量（分別為1%、2%、、3%）的試樣取樣檢測，采用一階HILL方程模擬胃蛋白酶提取豬皮膠原蛋白的進程以及胃蛋白酶水解速率的衰減過程，現在得出2%的胃蛋白酶用量和6-7h的水解時間提取率比較大。還有人用以新鮮豬皮為原料，在50-52℃的條件下用胰酶進行水解，在酶用量為5000：1～10000：1，pH值為9，反應2－3h，原料：水為1：2的條件下酶解。結果表明：總蛋白質的提取率≥80%。
堿法提取即利用一定濃度的堿在一定的外界條件下提取膠原蛋白，堿處理法中常用的處理劑為石灰、氫氧化鈉、碳酸鈉等，用氫氧化鈉浸提時效果較好。一般的是把樣品勻漿后，用堿溶液多次溶脹后，再離心提取。但由于易引起蛋白質變性，如膠原肽鍵水解，含羥基、疏基的氨基酸全部被破壞；所得產物等電點pH值較低，天冬酞胺和谷氨酞胺分別轉變為天冬氨酸和谷氨酸，得到的水解產物分子量較在酸性溶液中比低等問題，若比較嚴重的話，還會產生D、L-型氨基酸消旋混合物，若D型氨基酸含量高過L型氨基酸，則會抑制L-型氨基酸的吸收，有些D型氨基酸有毒，甚至有致ai、致畸和致突變的作用。而且堿法提取的含量較低，用氫氧化鈉從魷魚皮中提取堿溶性膠原蛋白，其得率只有3%（以濕基計）。所以，若想提取結構完整、使用安全的膠原蛋白，很少采用此方法。有關單獨采用堿法提取膠原蛋白的報道不多，一般是堿法提取和酸法提法結合使用。比如在4℃條件下，魚骨用，再用，用10%的異丙醇溶液去除脂肪，，現在得到無色無味的膠原蛋白，提取率為。 需要的膠原蛋白，其實是一種由3個氨基酸分子組成的膠原蛋白即“膠原三肽”。
預處理除膠原蛋白外，動物骨中還含有油脂、多種礦物質和其他雜質，因此在被用于提取膠原蛋白之前必須進行預處理。先剔除動物骨上殘留的肉質和肌腱等雜物，粉碎后用正丁醇或正己烷萃取出骨油。現在除去骨中無機物以提高膠原蛋白的得率。除去骨中的礦物質可用稀酸或EDTA溶液。有人用原料用5倍質量的，用正乙烷脫脂后再用胃蛋白酶酶解，在加酶量150U/g，pH值，37℃條件下處理120min，然后在固液比1∶6的情況下抽提5h，在此條件下，提取率可達18%；還有人用EDTA溶液（）浸泡骨料5d，可有效脫去骨料中的羥基磷灰石。[87-89]膠原蛋白的提取一般有三種方法：一是高壓輔助的物理方法；二是用溶劑預處理結合低溫或熱水抽提的化學方法，根據溶劑的不同，可分為熱水浸提法、酸法、堿法、鹽法；三是用酶的生物化學法。一般來說，高壓輔助和熱水抽提針對明膠的提取，而低溫抽提和酶法針對膠原的提取，但其基本原理都是根據膠原蛋白的特性改變蛋白質所在的外界環境，把膠原蛋白從其他蛋白質中分離出來。 溫度過高會引起酶的失活和膠原蛋白的變性。天津牡蠣膠原蛋白
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